酶水解和彻底水解的区别在于，酶水解生成的产物由酶的特性决定，而这个产物可能还能够进一步水解。而彻底水解时，产物就不能再被继续水解了。

比如蛋白质的水解。有很多蛋白酶只能将蛋白质水解为小一点的肽链。肽链其实还可以进一步水解为氨基酸，但是这种蛋白酶的功能到此为止，不能再继续水解肽链了。而彻底水解，产物就是小分子的氨基酸。