一种基于先验知识和网络拓扑特性的关键蛋白预测方法
专利名称 | 一种基于先验知识和网络拓扑特性的关键蛋白预测方法 | ||
专利状态 | 专利类型 | 发明专利 | |
公开号 |
CN201210513154.1
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申请号 | |||
专利申请日期 | 2012-12-04 | 专利授权日期 | 2015-05-27 |
发明人 | 李敏;张含会;王建新 | ||
权利人 | |||
专利摘要 | 本发明公开了一种基于先验知识和网络拓扑特性的关键蛋白预测方法。基于对已知关键蛋白之间拓扑关系的分析发现关键蛋白之间联系紧密,将边聚集系数作为评估两个关键蛋白紧密程度的参数,并利用部分已知关键蛋白,以及其邻居节点与这些已知关键蛋白之间的共簇系数来预测新的关键蛋白。本发明实现简单,只需根据PPI信息和部分已知关键蛋白信息就能够较准确地预测未知关键蛋白,既能用于非加权PPI网络,也能用于加权PPI网络,解决了化学实验方法成本昂贵、耗时等问题。 |
本发明公开了一种基于先验知识和网络拓扑特性的关键蛋白预测方法(专利号201210513154.1)。基于对已知关键蛋白之间拓扑关系的分析发现关键蛋白之间联系紧密,将边聚集系数作为评估两个关键蛋白紧密程度的参数,并利用部分已知关键蛋白,以及其邻居节点与这些已知关键蛋白之间的共簇系数来预测新的关键蛋白。本发明实现简单,只需根据PPI信息和部分已知关键蛋白信息就能够较准确地预测未知关键蛋白,既能用于非加权PPI网络,也能用于加权PPI网络,解决了化学实验方法成本昂贵、耗时等问题。